Ribulose

Ribulose

Caractéristiques du Ribulose

Identification du Ribulose :

Nom UICPA : D-érythro-2-pentulose ; L-érythro-2-pentulose
Synonymes : D-ribulose ; ribulose ; (3R,4R)-1,3,4,5-tetrahydroxypentan-2-one ; 488-84-6 ; D-erythro-Pent-2-ulose ; arabinocétose ; arabinulose ; ribocétose
N° CAS : 488-84-6 ; 5556-48-9
N° ECHA : –
N° CE : 207-687-8
Code ATC : –
PubChem : 51261
ChEBI : 28721
FEMA : –
SMILES :C(C(C(C(=O)CO)O)O)O ; C([C@H]([C@H](C(=O)CO)O)O)O
InChl : 1S/C5H10O5/c6-1-3(8)5(10)4(9)2-7/h3,5-8,10H,1-2H2/t3-,5-/m1/s1

Propriétés chimiques :

Formule : C5H10O5
Masse molaire : 150,129 9 ± 0,006 2 g/mol C 40 %, H 6,71 %, O 53,29 %
pKa : –

Propriétés physiques :

T° Fusion : –
Solubilité : –

Propriétés biochimiques :

Codons : –
pH isoélectrique : –
Acide aminé essentiel : –
Occurrence chez les vertébrés : –

Propriétés optiques :

Pouvoir rotatoire : –

Précautions :

SIMDUT : –

Tout savoir sur le ribulose : sa description, sa structure et ses rôles biologiques

Le ribulose est un membre de la classe des monosaccharides, participant à la formation de biomolécules. Il est présent sous différentes formes dans les organismes végétaux, chacune jouant un rôle spécifique. Plus précisément, cet ose prend part au cycle de Calvin, une séquence de réactions biochimiques qui ont lieu au sein des cellules végétales, principalement à l’intérieur des chloroplastes.

Description du ribulose

Le ribulose est classé parmi les cétopentoses, une catégorie d’oses composés de cinq atomes de carbone. Il présente une structure de type cétose, signifiant que son groupe carbonyle prend la forme d’une cétone située sur le deuxième carbone, comme illustré dans la représentation de Fischer pour ce groupe particulier.

À l’instar des autres cétopentoses, sa forme chimique est C₅H₁₀O₅.

Structure du ribulose

Le ribulose se trouve sous deux formes énantiomères distinctes : le L-ribulose, aussi appelé L-érythro-2-pentulose, et le D-ribulose, connu également sous le nom de D-érythro-2-pentulose. Ce dernier est la stéréoisomérie de configuration non énantiomérique (diastéréoisomère) du D-xylulose. En milieu aqueux, il existe sous trois conformations : deux tautomères (α-D-Ribulofuranose et β-D-Ribulofuranose) qui sont de type cyclique et une forme linéaire.

Rôles biologiques du ribulose

Le ribulose est l’un des éléments importants dans le métabolisme énergétique, notamment dans la voie des pentoses phosphates. Il participe à la création de diverses biomolécules. Il est présent à de faibles concentrations dans l’urine. Toutefois, sa forme prédominante est le ribulose-5-phosphate.

Le ribulose en tant que D-ribulose

L’un de ses énantiomères, le D-ribulose, intervient en tant que médiateur dans la synthèse du D-arabitol au sein de la voie métabolique des champignons.

Le ribulose en tant que ribulose-1,5-bisphosphate

Le ribulose prend également une forme phosphatée, le RuBP ou ribulose-1,5-bisphosphate. Aussi identifié sous le nom de ribulose-1,5-diphosphate, il émerge en tant que métabolite essentiel au sein du cycle de Calvin, une séquence de réactions métaboliques se produisant pendant la photosynthèse. Durant cette phase, le RuBP devient le site d’action de la Rubisco, une enzyme clé dédiée à la fixation du dioxyde de carbone atmosphérique. Elle catalyse la fixation du CO₂ sur un pentose, formant ainsi deux molécules organiques distinctes, chacune comprenant trois atomes de carbone (C). Cette réaction aboutit à un gain net d’un atome de C organique, représentant un élément fondamental pour la croissance des organismes photosynthétiques. En somme, le RuBP joue un rôle central en facilitant la fixation efficace du carbone atmosphérique au cours du processus photosynthétique, contribuant ainsi à la production de matière organique essentielle à la vie des organismes.

Le ribulose en tant que ribulose-5-phosphate

Le ribulose-5-phosphate (Ru5P) est l’ester phosphorique du ribulose, un métabolite dérivé du glucose grâce à l’oxydation décarboxylante de l’acide phosphogluconique. Il se positionne comme le précurseur immédiat de deux de ses isomères essentiels, à savoir le ribose-5-phosphate et le xylulose-5-phosphate.

Dans la voie des pentoses phosphates, le Ru5P se profile comme l’un des résultats finaux de la phase oxydative. Il se place comme intermédiaire clé du cycle de Calvin.

Il est issu du 6-phosphogluconate grâce à l’action de la 6-phosphogluconate déshydrogénase. De plus, le Ru5P peut subir des modifications cruciales orchestrées par des enzymes spécifiques, telles que la ribulose-phosphate 3-épimérase et la ribose-5-phosphate isomérase.

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